在實際業務中，加工貿易企業已經內銷補稅的保稅料件有可能因故無法內銷的情況。料件就此廢棄也太過于浪費，往往會重新投入生產。這種情況會造成加工貿易電子手冊或電子賬冊在庫不平衡，相關料件在庫盈余，所以需要根據料件的數量重新備案成品。
如果是電子手冊，則向海關申請備案一個新的成品，單耗構成中不包含已經內銷補稅的保稅料件。如果是電子賬冊，則在原成品項下申請多一個版本號的成品，同樣的單耗構成中不包含已經內銷補稅的保稅料件。
備案完成后，出口使用也有些注意事項。生產管理部門盡可能安排這批料件先生產，先出口，至料件耗用完后馬上停止使用新備案成品出口，恢復原有成品的出口。
如果企業的管理無法做到生產和備案同步，則關務部門要管理出口數量，當上述料件可以生產的成品出口完畢后，立即停止使用新備案成品出口，恢復原有成品的出口。
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